Zoologická zahrada se nachází na kraji čtvrti Krásné Březno.
Směr od Prahy: stále po hlavní silnici, po Labském nábřeží, za novým mostem první odbočka vlevo (světelná křižovatka) po zhruba 100 m vpravo je parkoviště přímo naproti hlavnímu vchodu do zoo.
Směr od Teplic: po dálniční spojce, na kruhovém objezdu na konci spojky, směr Děčín, po Labském nábřeží, za novým mostem první odbočka vlevo (světelná křižovatka) po zhruba 100 m vpravo je parkoviště přímo naproti hlavnímu vchodu do zoo.
Směr od Litoměřic: po střekovské straně směrem na Děčín, dále odbočit vlevo na nový most (Krásné Březno), na mostě vpravo, po sjezdu první odbočka vlevo (světelná křižovatka), po zhruba 100 m vpravo je parkoviště přímo naproti hlavnímu vchodu do zoo.
Směr od Děčína: stále po hlavní, před nájezdem na přemostění železniční tratě odbočit vpravo směrem na Krásné Březno, kolem pivovaru. Zhruba 500 m za pivovarem vlevo je parkoviště přímo naproti hlavnímu vchodu do zoo.
Vlakem: železniční stanice Ústí nad Labem, hlavní nádraží je od zoo vzdálena cca 2 km. Zoo je z centra města dostupná městskou hromadnou dopravou z Mírového náměstí (cca 200 m od Hlavního nádraží), trolejbusové linky č. 51, 55, 56, 57, 58, 59 směr Krásné Březno, zastávka „Vojanova ZOO“ je nedaleko hlavního vchodu v Drážďanské ulici.
PARKOVIŠTĚ: Kromě spodního parkoviště naproti hlavnímu vchodu do zoo (Drážďanská ulice) je možné během hlavní letní sezóny využít i horní vchod z ulice Výstupní, kde je k dispozici také malé parkoviště.